Застосування інформаційної технології BLAST для пошуку мікроорганізмів, потенційних продуцентів біогенних магнітних наночасток, які призводять до серцевих захворювань

Автор(и)

  • І. А. Межієвська Вінницький національний медичний університет ім. М. Пирогова https://orcid.org/0000-0003-0676-379X
  • С. В. Павлов Вінницький національний технічний університет https://orcid.org/0000-0002-0051-5560
  • Г. Б. Кашаганова Алматинський технологічний університет https://orcid.org/0000-0002-5213-4882
  • В. Ю. Масловський Вінницький національний медичний університет ім. М. Пирогова https://orcid.org/0000-0001-5184-1799
  • Д. Х. Штофель Вінницький національний технічний університет https://orcid.org/0000-0002-9807-5179
  • О. С. Волосович Вінницький національний технічний університет https://orcid.org/0000-0002-5497-6805

DOI:

https://doi.org/10.31649/1681-7893-2023-46-2-117-123

Ключові слова:

інформаційна технологія BLAST, вирівнювання білків, серцеві захворювання

Анотація

За допомогою інформаційної технології BLAST методами порівняльної геноміки проведено вирівнювання білків МТБ з білками патогенних та умовно патогенних мікроорганізмів, збудників серцевих захворювань, зокрема, міокардиту у людини.

Біографії авторів

І. А. Межієвська, Вінницький національний медичний університет ім. М. Пирогова

к.м.н, доцент кафедри внутрішньої медицини No. 3

С. В. Павлов, Вінницький національний технічний університет

д.т.н., професор кафедри біомедичної інженерії та оптико-електронних систем

Г. Б. Кашаганова, Алматинський технологічний університет

Доктор  Ph.D.  асоційований професор, Інститут автоматики та інформаційних технологій, Кафедра Електроніки, телекомунікації та космічних технологій

В. Ю. Масловський, Вінницький національний медичний університет ім. М. Пирогова

д.м.н, доцент кафедри внутрішньої медицини No. 3

Д. Х. Штофель, Вінницький національний технічний університет

к.т.н., доцент кафедри біомедичної інженерії та оптико-електронних систем

О. С. Волосович, Вінницький національний технічний університет

магістр, аспірант кафедри біомедичної інженерії та оптико-електронних систем

Посилання

Yang X., Gokulnath P., Lehmann H. I., & Shang H. RNA modifications in aging-associated cardiovascular diseases. Aging (Albany NY). 2022 Sep 29;14(19):8110-8136. doi: 10.18632/aging.204311. Epub 2022 Sep 29. PMID: 36178367; PMCID: PMC9596201.

Ammirati, E., Frigerio, M., Adler, E. D., & Camici, P. G. (2020). Management of Acute Myocarditis and Chronic Inflammatory Cardiomyopathy: An Expert Consensus Document. Circulation. Heart failure, 13(11), e007405. https://doi.org/10.1161/CIRCHEARTFAILURE.120.007405

Lampejo, T., Durkin, S. M., Bhatt, N., & Guttmann, O. (2021). Acute myocarditis: aetiology, diagnosis and management. Clinical medicine (London, England), 21(5), e505–e510. https://doi.org/10.7861/clinmed.2021-0121

Tschöpe, C., Cooper, L. T., Torre-Amione, G., & Van Linthout, S. (2019). Management of Myocarditis-Related Cardiomyopathy in Adults. Circulation research, 124(11), 1568–1583. https://doi.org/10.1161/CIRCRESAHA.118.313578

Iung B. (2019). Endocardite infectieuse. Épidémiologie, physiopathologie et anatomopathologie [Infective endocarditis. Epidemiology, pathophysiology and histopathology]. Presse medicale (Paris, France : 1983), 48(5), 513–521. https://doi.org/10.1016/j.lpm.2019.04.009

Vogkou, C. T., Vlachogiannis, N. I., Palaiodimos, L., & Kousoulis, A. A. (2016). The causative agents in infective endocarditis: a systematic review comprising 33,214 cases. European journal of clinical microbiology & infectious diseases : official publication of the European Society of Clinical Microbiology, 35(8), 1227–1245. https://doi.org/10.1007/s10096-016-2660-6

Thompson, G. R., 3rd, Jenks, J. D., Baddley, J. W., & Hoenigl, M. (2023). Fungal Endocarditis: Pathophysiology, Epidemiology, Clinical Presentation, Diagnosis, and Management. Clinical microbiology reviews, 36(3), e0001923. https://doi.org/10.1128/cmr.00019-23

Victoria Delgado, Nina Ajmone Marsan, Suzanne de Waha, & Michael A Borger, ESC Scientific Document Group, 2023 ESC Guidelines for the management of endocarditis: Developed by the task force on the management of endocarditis of the European Society of Cardiology (ESC) Endorsed by the European Association for Cardio-Thoracic Surgery (EACTS) and the European Association of Nuclear Medicine (EANM), European Heart Journal, Volume 44, Issue 39, 14 October 2023, Pages 3948–4042, https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehad193

Pertsemlidis A; Fondon JW (2001). “Having a BLAST with bioinformatics (and avoiding BLASTphemy)”. Genome Biology. 2 (10): reviews2002.1. DOI:10.1186/gb-2001-2-10-reviews2002. PMID 11597340.

Altschul SF; Gish W; Miller W; Myers EW; Lipman DJ (1990). “Basic local alignment search tool”. Journal of Molecular Biology. 215 (3): 403—410. DOI:10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712.

Boratyn GM; Schäffer AA; Agarwala R; Altschul SF; Lipman DJ; Madden TL (2012). “Domain enhanced lookup time accelerated BLAST”. Biology Direct. 7: 12. DOI:10.1186/1745-6150-7-12

S.V. Gorobets, O.Yu. Sparrow, K.O. Butenko. Potential producers of biogenic magnetic nanoparticles among pathogenic and opportunistic microorganisms, , Innov Biosyst Bioeng, 2018, vol. 2, no. 1, 33–41 doi: 10.20535/ibb.2018.2.1.127260

Gorobets SV, Gorobets OYu. Function of biogenic magnetic nanoparticles in organisms. Functional Mater. 2012;19(1):18-26. DOI: 10.1002/adfm.v22.24

Gorobets SV, Gorobets OYu. Biomineralization of biogenic magnetic nanoparticles and their possible functions in cells of prokaryotes and eukaryotes. In: Dekker Encyclopedia of Nanoscience and Nanotechnology. 3rd ed. Taylor&Francis; 2014. p. 300-6.

##submission.downloads##

  • PDF
    Завантажень: 107
Переглядів анотації: 139

Опубліковано

2023-12-13

Як цитувати

[1]
І. А. Межієвська, С. В. Павлов, Г. Б. Кашаганова, В. Ю. Масловський, Д. Х. Штофель, і О. С. Волосович, «Застосування інформаційної технології BLAST для пошуку мікроорганізмів, потенційних продуцентів біогенних магнітних наночасток, які призводять до серцевих захворювань», Опт-ел. інф-енерг. техн., вип. 46, вип. 2, с. 117–123, Груд 2023.

Номер

Том 46 № 2 (2023)

Розділ

Біомедичні оптико-електронні системи та прилади

Метрики

Завантаження

Дані завантаження ще не доступні.

Ліцензія

Автори, які публікуються у цьому журналі, погоджуються з наступними умовами:

  1. Автори залишають за собою право на авторство своєї роботи та передають журналу право першої публікації цієї роботи на умовах ліцензії Creative Commons Attribution License, котра дозволяє іншим особам вільно розповсюджувати опубліковану роботу з обов'язковим посиланням на авторів оригінальної роботи та першу публікацію роботи у цьому журналі.
  2. Автори мають право укладати самостійні додаткові угоди щодо неексклюзивного розповсюдження роботи у тому вигляді, в якому вона була опублікована цим журналом (наприклад, розміщувати роботу в електронному сховищі установи або публікувати у складі монографії), за умови збереження посилання на першу публікацію роботи у цьому журналі.
  3. Політика журналу дозволяє і заохочує розміщення авторами в мережі Інтернет (наприклад, у сховищах установ або на особистих веб-сайтах) рукопису роботи, як до подання цього рукопису до редакції, так і під час його редакційного опрацювання, оскільки це сприяє виникненню продуктивної наукової дискусії та позитивно позначається на оперативності та динаміці цитування опублікованої роботи (див. The Effect of Open Access).

Статті цього автора (авторів), які найбільше читають

1 2 3 > >>